日本商标注册主管机关为日本专利局(JPO)，其前身是1885年设立的“专卖特许所”，现为隶属于经济产业省的政府机构，现更名为日本专利局(JPO)。
注册日本商标时间及流程：
1、商标注册申请递交到日本特许厅；
2、形式审查阶段：审查申请文件是否齐备，必填项目是否填写完整。如不符合要求，通知申请人更正；
3、实质审查阶段：审查商标是否满足实质审查要求；
4、通过实质审查，做出允许商标注册的决定；
5、未能满足要求者发出驳回理由通知书，申请人对此出具抗辩书或理由书；
6、交付注册费用后，商标注册权确立，商标权开始存在，予以公告，异议期两个月；
7、如果抗辩书或理由书不能消除驳回理由，驳回裁定成立；
8、对裁定不服可以起诉；
9、如果对起诉结果不满，可向东京高级法院提起上诉。如果仍不服，可继续向高级法院提起上诉。
日本商标注册办理资料：
申请人资格证明资料(申请人名称、地址和国籍)/注册的商品或者服务/清晰的商标图样/商标注册委托书/相关费用。
1、申请人的身份证、营业执照（中、英、日文名称及地址）；
2、商品或服务项目；
3、商标图样；
4、一份《注册日本商标委托书》填写一个文字商标及一个类别的商品或服务项目。
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