在自贸区注册内资企业与外资企业流程有以下区别：
内资企业
①名称核准；
②“一口受理”窗口提交材料；
③各部门审核；
④统一发证窗口领证。
外资公司
①名称核准；
②负面清单比对；
③互联网“一表申报”；
④“一口受理”窗口提交材料；
⑤各部门审核（备案）；
⑥统一发证窗口领证。
从实务操作情况来看，无论是内资企业，还是从事“负面清单”外业务的外资企业，若所有材料齐全，从材料递交到取得各类证照，一般一周内便可完成。具体材料要求可参照自贸区门户网站公示内容予以办理。
公司注册地址的要求：
自贸区内注册公司，注册地址要求与区外一样。凡注册在自贸区内的公司，注册地址必须是自贸区内的合法商业用房、厂房、仓库等。
按照2012年修订的《规范企业注册地管理规定》标准要求，对商贸企业提供注册地应不小于20平方米的独立空间，且办公房室号准确无重复；对企业仓储注册地应不小于30平方米，且仓储部位分隔合理。产权证明上同一地址（室号、部位）的房屋只能登记为一家企业经营场所。
特别提醒：
①在自贸区内注册公司，须与自贸区内有物业的公司签订房屋租赁合同，租赁其办公、生产或仓储场地用于公司注册；
②在签约之前，务必前往自贸区工商主管部门查询，该注册地址是否可以用于公司注册，是否有第三方企业已经使用了该注册地址。
